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Biologia Molecolare
Trasfezione PDF Stampa E-mail
Biotecnologia - Biologia Molecolare
Scritto da Valeria Daví   

Si intende per trasfezione l’introduzione di molecole di varia natura (DNA,RNA, proteine) in cellule eucaristiche. Solitamente comunque si fa riferimento all’introduzione di acidi nucleici.

In questo ultimo caso abbiamo tre fasi:

  1. internalizzazione;
  2. trasporto nel nucleo e stabilizzazione(spesso questo passaggio non è ben compreso, ma avviene);
  3. espressione del gene trasfettato.
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SOS Recruitment System PDF Stampa E-mail
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Biotecnologia - Biologia Molecolare
Scritto da Valeria Daví   

È una delle varianti del Two Hybrid System, applicabile però alle proteine citoplasmatiche.
Considerando di voler saggiare l’interazione proteina-proteina tra X e Y si agirà miristilando Y, ovvero apportando ad essa una modificazione che la renda tale da legare la membrana. Con X invece si crea una proteina di fusione legata all’ hSOS ( human SOS), la GEF umana, in grado di scambiare GDP con GTP nella proteina RAS (ricordiamo che il ciclo di RAS è necessario per la crescita e la proliferazione cellulare).

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Two Hybrid System PDF Stampa E-mail
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Biotecnologia - Biologia Molecolare
Scritto da Valeria Daví   

Chiamato spesso Yeast  Two Hybrid (YTH) e una delle metodiche utilizzate per lo studio delle interazioni proteina-proteina.

Come sappiamo i fattori di trascrizione sono costituiti tra l’altro da un dominio di legame al DNA: Binding Domain (BD); e da un dominio di attivazione della trascrizione: Activation Domain (AD). In realtà i due domini non devono necessariamente essere parte dello stesso peptide per risultare funzionanti, ma è sufficiente che essi siano vicini.

Il YTH sfrutta proprio questa caratteristica, in particolare del fattore di trascrizione GAL4.  Supponendo di voler saggiare l’interazione tra le proteine X e Y si creano due proteine di fusione a partire da due plasmidi: Gal4BD-X   e   Gal4AD-Y.

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EMSA (Elettroforetic Mobility Shift Assay) PDF Stampa E-mail
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Biotecnologia - Biologia Molecolare
Scritto da Valeria Daví   
È un saggio di mobilità elettroforetica per studiare le interazioni tra presunti fattori di trascrizione e i possibili oligonucleotidi da essi legati.

In vitro si sintetizza la sonda: un oligonucleotide duble strain di nostro interesse e si marca terminalmente con P32.

Si incuba poi con estratti proteici provenienti da cellule che esprimono i geni studiati, nel momento di massima espressione. Se l’oligonucleotide è davvero un elemento di cis regolazione esso dovrebbe venir legato da una delle proteine dell’estratto.

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