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Biotecnologia -
Biologia Molecolare
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Scritto da Valeria Daví
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Si intende per trasfezione l’introduzione di molecole di varia natura (DNA,RNA, proteine) in cellule eucaristiche. Solitamente comunque si fa riferimento all’introduzione di acidi nucleici. In questo ultimo caso abbiamo tre fasi: - internalizzazione;
- trasporto nel nucleo e stabilizzazione(spesso questo passaggio non è ben compreso, ma avviene);
- espressione del gene trasfettato.
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Biotecnologia -
Biologia Molecolare
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Scritto da Valeria Daví
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È una delle varianti del Two Hybrid System, applicabile però alle proteine citoplasmatiche. Considerando di voler saggiare l’interazione proteina-proteina tra X e Y si agirà miristilando Y, ovvero apportando ad essa una modificazione che la renda tale da legare la membrana. Con X invece si crea una proteina di fusione legata all’ hSOS ( human SOS), la GEF umana, in grado di scambiare GDP con GTP nella proteina RAS (ricordiamo che il ciclo di RAS è necessario per la crescita e la proliferazione cellulare). |
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Biotecnologia -
Biologia Molecolare
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Scritto da Valeria Daví
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Chiamato spesso Yeast Two Hybrid (YTH) e una delle metodiche utilizzate per lo studio delle interazioni proteina-proteina. Come sappiamo i fattori di trascrizione sono costituiti tra l’altro da un dominio di legame al DNA: Binding Domain (BD); e da un dominio di attivazione della trascrizione: Activation Domain (AD). In realtà i due domini non devono necessariamente essere parte dello stesso peptide per risultare funzionanti, ma è sufficiente che essi siano vicini. Il YTH sfrutta proprio questa caratteristica, in particolare del fattore di trascrizione GAL4. Supponendo di voler saggiare l’interazione tra le proteine X e Y si creano due proteine di fusione a partire da due plasmidi: Gal4BD-X e Gal4AD-Y. |
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Biotecnologia -
Biologia Molecolare
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Scritto da Valeria Daví
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È un saggio di mobilità elettroforetica per studiare le interazioni tra presunti fattori di trascrizione e i possibili oligonucleotidi da essi legati. In vitro si sintetizza la sonda: un oligonucleotide duble strain di nostro interesse e si marca terminalmente con P32. Si incuba poi con estratti proteici provenienti da cellule che esprimono i geni studiati, nel momento di massima espressione. Se l’oligonucleotide è davvero un elemento di cis regolazione esso dovrebbe venir legato da una delle proteine dell’estratto. |
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